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HLA/免疫肽组学
📝 服务介绍
免疫肽组利用抗HLA抗体免疫沉淀HLA-肽复合物，释放结合肽段通过质谱鉴定，揭示抗原呈递谱，为肿瘤新抗原发现和疫苗设计提供直接证据。
🔬 实验原理
免疫肽组学原理：免疫肽组学分析MHC(主要组织相容性复合体)分子呈递的肽段。MHC-I(HLA-A/B/C)呈递细胞内蛋白降解产生的8-11aa肽段，MHC-II(HLA-DP/DQ/DR)呈递外源/溶酶体降解的12-25aa肽段。通过免疫沉淀MHC-肽段复合物后LC-MS/MS分析呈递肽段。
📋 应用领域
- MHC/新抗原肽组学鉴定
- 肿瘤新抗原发现
- HLA-I/II类结合肽谱绘制
- 免疫治疗靶点新抗原预测
- 免疫肽组用于疫苗设计
- MHC呈递差异与免疫逃逸
⭐ 服务优势
- 直接鉴定抗原：HLA结合肽
- 新抗原发现：肿瘤特异性抗原
- 疫苗设计依据：免疫原性肽段
- 兼容MHC I/II分型
🔄 服务流程
- 细胞/组织裂解
- 抗HLA抗体（W6/32等）免疫沉淀HLA-肽复合物
- 酸洗脱结合肽段
- 肽段纯化除盐
- nanoLC-MS/MS分析
- 肽段序列鉴定和来源蛋白注释
📋 服务详情 / 客户提供
| 项目 | 要求 |
|---|---|
| 样品 | 细胞>=10^8或组织>=1g |
| HLA类型 | 提供MHC I/II类型信息 |
| 研究目的 | 新抗原发现/自身免疫/移植抗原 |
| 样本数量 | 对照组+实验组 |
| 分析需求 | 肽段鉴定/来源蛋白/肿瘤特异性 |
📊 结果展示
HLA结合肽列表（含序列/来源蛋白/MHC亲和力预测）、新抗原候选列表及实验报告。
📦 最终交付
HLA结合肽列表（含序列/来源蛋白/MHC亲和力预测）、新抗原候选列表及实验报告。
Q: 免疫肽组需要多少细胞
建议>=10^8细胞（因HLA-肽段丰度极低）。可使用组织样本（>=1g肿瘤组织）。若细胞量不足可使用TMT多重标记混合提高通量。
Q: 鉴定到的肽段如何判断是否为新抗原
将肽段序列与肿瘤基因组/WES数据比对：来源于体细胞突变（missense/frameshift）的肽段为新抗原候选。用NetMHCpan预测MHC亲和力（IC50<500nM），结合肿瘤vs正常差异筛选。
Q: 免疫肽组怎么做
1)细胞/组织裂解(0.5% Triton/PBS)；2)MHC抗体(W6/32泛HLA或型别特异)免疫沉淀MHC-肽段复合物(4°C 4h)；3)酸洗脱(0.1% TFA)释放MHC结合肽段；4)超滤(10kDa MWCO)分离肽段(去除MHC蛋白)；5)C18 StageTip除盐；6)LC-MS/MS分析呈递肽段。需1-5×10^8细胞(大量MHC-肽段复合物)。
Q: 免疫肽组能做什么
1)肿瘤新抗原发现(突变肽段由MHC呈递被T细胞识别)；2)自身免疫病自身抗原(MHC呈递自身肽段)；3)病毒/细菌免疫肽段(病原体肽段MHC呈递)；4)MHC结合基序分析(HLA-A*02:01基序: XMXXXXXXL，X=任意，M=Methionine，L=Leucine)；5)免疫原性预测(NetMHCpan/MHCcluster预测MHC结合和T细胞识别)。
Q: MHC-I和MHC-II肽组区别
MHC-I(HLA-A/B/C)：内源肽段(蛋白酶体降解→TAP转运→ER内MHC-I结合)，长度8-11aa，CD8+T细胞识别，所有有核细胞表达。MHC-II(HLA-DP/DQ/DR)：外源/溶酶体肽段(内吞/自噬→溶酶体降解→MHC-II结合)，长度12-25aa，CD4+T细胞识别，APC(树突/巨噬/B细胞)表达。两者免疫肽组分析方法相同但抗体不同。
Q: 免疫肽组需要多少细胞
1-5×10^8细胞(每10^8细胞可洗脱约100-500pmol肽段，1-10μg肽段)。肿瘤组织：5-10g组织(手术标本)。建议2-5×10^8细胞/样本。MHC-I肽组(泛HLA抗体W6/32)比型别特异抗体产量高。可用TMT标记做多重MHC肽组定量(6-16通道)。
Q: 免疫肽组数据分析怎么做
1)搜库(MaxQuant/MSFragger/PEAKS)：无酶切(no enzyme)搜索全部可能的8-11aa肽段；2)MHC结合预测(NetMHCpan 4.1)：预测肽段-HLA结合亲和力(IC50<500nM为强结合)；3)突变肽段筛选(与参考基因组比对→突变肽段=新抗原)；4)T细胞识别预测(NetMHCstabpan/IEDB)：预测免疫原性。建议整合基因组(突变)+转录组(表达)+免疫肽组(呈递)全面发现新抗原。