Southern Blot
DNA印迹杂交
📝 服务介绍
Southern Blot通过限制性内切酶酶切基因组DNA、凝胶电泳分离、转膜后与标记探针杂交,检测特定DNA序列的大小和拷贝数,是基因组DNA分析的经典方法,常用于转基因鉴定、基因敲除验证等。
🔬 实验原理
Southern Blot原理:DNA经限制性内切酶消化后琼脂糖凝胶电泳分离,转移到尼龙膜上后用标记探针杂交,通过放射自显影或化学发光检测特定DNA序列。是检测DNA序列变异、基因拷贝数和转基因鉴定的经典方法。
📋 应用领域
- 外源基因整合位点与拷贝数鉴定
- 转基因动物/细胞系遗传完整性验证
- 基因重排/缺失/插入检测
- 特定DNA序列在基因组中金标准定性
- 转座子插入位点分析
- DNA甲基化与基因拷贝研究配套
⭐ 服务优势
- 高特异性:核酸探针精准识别
- 拷贝数分析:可区分不同整合拷贝数
- 经典方法:敲除/转基因鉴定标准
- 兼容同位素/化学发光
🔄 服务流程
- 基因组DNA提取与限制性内切酶消化
- 琼脂糖凝胶电泳分离DNA
- 毛细管转移法转膜
- 探针标记(同位素P32或地高辛)
- 杂交过夜、洗膜、显影
📋 服务详情 / 客户提供
| 项目 | 要求 |
|---|---|
| 基因组DNA | >=10ug,浓度>=100ng/uL |
| 探针序列 | 目的基因序列或已知片段 |
| 酶切位点信息 | 指定限制性内切酶或由平台建议 |
| 检测方式 | 同位素/地高辛化学发光 |
📊 结果展示
交付X光片/化学发光图像、DNA分子量marker及目的条带位置标注、实验报告。
📦 最终交付
交付X光片/化学发光图像、DNA分子量marker及目的条带位置标注、实验报告。
Q: Southern Blot杂交信号弱怎么处理
优化探针标记效率(确保>50%)、增加探针浓度、延长杂交时间(16h)、降低洗膜温度(65->55C)。确认转膜效率。
Q: 基因敲除验证选用哪种酶切
选择在打靶序列两侧的限制性内切酶,使野生型与敲除等位基因产生不同大小片段。
Q: Southern Blot怎么做
1)基因组DNA(10-20μg)酶切(过夜);2)琼脂糖凝胶电泳分离(0.7%胶低电压过夜);3)变性(0.5M NaOH)→中和(Tris);4)毛细管转移至尼龙膜(过夜);5)紫外交联固定DNA;6)预杂交(Church buffer 65°C 2h);7)探针杂交(标记探针42°C/65°C过夜);8)洗膜→检测(放射自显影/化学发光)。
Q: Southern Blot探针怎么标记
1)同位素P32-标记:随机引物法/切口平移法标记DNA探针,灵敏度高但需放射防护;2)地高辛(DIG):非同位素标记,化学发光检测(anti-DIG-AP+CSPD),安全简便;3)生物素:链霉亲和素-HRP检测。建议DIG标记(安全灵敏接近同位素)。探针长度300-1000bp特异性好。
Q: Southern Blot和PCR检测有什么区别
Southern Blot:检测基因组DNA特定序列(长度/拷贝数),不需要PCR扩增,结果可靠(无PCR偏倚),但耗时3-5天、灵敏度低(需μg级DNA)、通量低。PCR:快速灵敏但需PCR扩增(可能有非特异扩增或偏倚)。转基因鉴定/基因敲除验证/基因拷贝数选Southern Blot(金标准)。
Q: Southern Blot能检测什么
1)转基因鉴定(外源基因整合和拷贝数);2)基因敲除验证(靶向构建引起限制酶切长度变化);3)基因重排(B/T细胞受体基因重排);4)RFLP(限制片段长度多态性);5)基因扩增/缺失(拷贝数变异);6)病毒整合位点分析。每次需10-20μg基因组DNA。
Q: Southern Blot信号弱怎么办
1)DNA量不够(增加至20-30μg);2)酶切不充分(增加酶量2-3倍过夜酶切);3)转移效率低(检查毛细管转移系统确保缓冲液连续);4)探针比活低(重新标记探针检查掺入率);5)杂交条件不合适(降低杂交温度增加灵敏度);6)洗膜太严(降低洗膜温度/盐浓度)。设阳性对照(已知含靶序列的DNA)。