多修饰组学
翻译后修饰多组学
📝 服务介绍
多修饰组学在同一项目中同时分析磷酸化、泛素化、乙酰化等多种翻译后修饰,揭示修饰crosstalk和调控网络,提供更全面的蛋白功能调控图谱。
🔬 实验原理
多重翻译后修饰组原理:多重翻译后修饰分析同时对蛋白质进行多种修饰(磷酸化/泛素化/乙酰化/甲基化/糖基化)的全局分析,通过分别富集不同修饰肽段后LC-MS/MS检测,研究修饰间crosstalk和组合调控。
📋 应用领域
- 多修饰组学联合分析(磷/泛素/乙酰/糖)
- 多PTM互作协调机制研究
- 差异修饰网络的全局视图
- 同一蛋白多修饰位点注释
- PTM调控信号通路关联分析
- 蛋白质功能多样性解析
⭐ 服务优势
- 多修饰覆盖:磷酸化/泛素化/乙酰化等
- 修饰crosstalk分析
- 统一分析框架:消除批次差异
- 深度调控网络
🔄 服务流程
- 蛋白提取定量(大量制备>=5mg)
- 等分多份分别做不同修饰富集
- 各修饰类型质谱分析(同批次)
- 统一数据分析流程
- 修饰crosstalk分析
- 调控网络整合
📋 服务详情 / 客户提供
| 项目 | 要求 |
|---|---|
| 样品 | 蛋白>=5mg/样本(需大量) |
| 样本数量 | >=2组 每组>=2-3重复 |
| 修饰类型 | 磷酸化+泛素化+乙酰化(可定制) |
| 分析需求 | 各修饰差异/crosstalk/调控网络 |
| 特殊要求 | 统一提取批次减少变异 |
📊 结果展示
各修饰位点列表、修饰crosstalk分析图、调控网络图、整合分析报告。
📦 最终交付
各修饰位点列表、修饰crosstalk分析图、调控网络图、整合分析报告。
Q: 多修饰组学需要多少蛋白量
每种修饰富集需要1-2mg,3种修饰需3-6mg总蛋白。建议从10^8细胞起步提取蛋白,或使用TMT标记后混合减少起始量。
Q: 修饰crosstalk如何分析
使用同一蛋白上不同修饰的变化进行关联分析(如磷酸化和泛素化同时上调的蛋白),绘制修饰crosstalk网络。也可分析同一肽段上不同修饰的互斥/协同模式。
Q: 多重PTM怎么做
1)蛋白提取(含蛋白酶/磷酸酶/去乙酰化酶/去泛素酶抑制剂);2)胰酶消化→肽段;3)等分多份分别富集不同修饰(磷酸化TiO2/泛素化K-ε-GG/乙酰化抗K-Ac/甲基化/糖基化HILIC);4)各修饰肽段分别LC-MS/MS分析;5)数据整合分析修饰crosstalk。需10-50mg总蛋白(每种修饰需5-10mg)。
Q: 多重PTM crosstalk怎么分析
1)同一蛋白上不同修饰位点共现分析(如组蛋白H3K9me3+H3K27me3共现);2)修饰-修饰关联(磷酸化vs乙酰化变化趋势是否一致/相反);3)激酶/乙酰转移酶/泛素连接酶的底物重叠分析(同一蛋白被多种修饰酶调控);4)整合多PTM数据构建修饰网络(Cytoscape)。文献报道H3K9ac+H3K4me3(共激活)/H3K9me3+H3K27me3(共抑制)。
Q: 多重PTM需要多少蛋白
磷酸化5-10mg、泛素化10-20mg、乙酰化5-10mg、糖基化1-5mg、甲基化5-10mg。多重PTM需起始10-50mg总蛋白(每种修饰分别取等分消化后富集)。建议20-30mg起始蛋白(3-5种修饰)。可用TMT标记后分通道做不同修饰(减少总蛋白量)。
Q: 多重PTM和单PTM区别
多重PTM:同时分析多种修饰,揭示修饰间crosstalk和组合调控,但需要大量蛋白和多次富集(成本高/周期长)。单PTM:分析一种修饰(如磷酸化),深度高但无法分析修饰间互作。修饰crosstalk/组合调控研究选多重PTM,特定修饰深度分析选单PTM。建议先做单PTM初筛→多重PTM验证crosstalk。
Q: 多重PTM能做什么
1)组蛋白修饰crosstalk(H3K9ac/H3K27me3/H3K4me3组合调控基因表达);2)信号通路多PTM调控(磷酸化+泛素化协同调控蛋白稳定性/活性);3)药物多PTM调控(HDAC抑制剂影响乙酰化+磷酸化);4)疾病多PTM标志物(肿瘤磷酸化+泛素化差异)。整合多PTM+蛋白表达组+转录组(修饰-表达-mRNA关联分析)。