RT-qPCR
实时荧光定量PCR
📝 服务介绍
RT-qPCR通过荧光信号实时监测PCR扩增进程,结合2^-DDCt法对靶基因进行精确定量,是基因表达分析的"金标准"。
🔬 实验原理
RT-qPCR原理:利用荧光染料(SYBR Green)或特异性探针(TaqMan)在PCR扩增过程中实时检测荧光信号。SYBR Green结合双链DNA后荧光增强;TaqMan探针在扩增时被切割释放荧光。通过Ct值(循环阈值)与标准曲线对比,实现靶基因精确定量。2^-ΔΔCt法将靶基因Ct值经内参基因校正后计算相对表达量。
📋 应用领域
- 基因表达定量与差异表达分析
- 药物处理/siRNA/shRNA干预后靶基因表达验证
- 肿瘤标志物与疾病相关基因筛查
- RNA病毒载量检测(拷贝数绝对定量)
- miRNA/lncRNA/circRNA表达分析
- 临床样本基因分型与诊断辅助
⭐ 服务优势
- 高灵敏度:可检测单拷贝级别模板
- 高特异性:TaqMan探针或SYBR Green双重验证
- 通量灵活:支持96/384孔板
- 多重检测:支持多靶基因同时检测
🔄 服务流程
- RNA提取与质量检测(OD260/280>=1.8)
- 逆转录合成cDNA
- 引物/探针设计与预实验优化
- qPCR扩增(40循环+熔解曲线)
- 数据分析:2^-DDCt法计算相对表达量
📋 服务详情 / 客户提供
| 项目 | 要求 |
|---|---|
| RNA/细胞/组织样品 | 新鲜或冻存,细胞>=10^6,组织>=50mg |
| 引物序列 | 提供靶基因名称/序列或委托设计 |
| 内参基因 | GAPDH/actin等,可由平台提供 |
| 实验分组 | 对照组/实验组明确,重复>=3 |
📊 结果展示
交付完整报告,包含RNA质检图、扩增曲线、熔解曲线、相对表达量柱状图(含统计检验)及原始Ct数据。
📦 最终交付
交付完整报告,包含RNA质检图、扩增曲线、熔解曲线、相对表达量柱状图(含统计检验)及原始Ct数据。
Q: qPCR熔解曲线出现杂峰怎么办
杂峰通常由引物二聚体或非特异性扩增引起。建议优化退火温度(梯度PCR)、降低引物浓度、检查引物特异性(BLAST比对),必要时重新设计引物。
Q: RNA提取后OD260/280偏低怎么办
比值<1.8提示蛋白污染。可增加氯仿抽提次数、减少样本用量;若样品富含蛋白建议使用TRIzol重抽。
Q: 内参基因选择有什么讲究
内参基因应稳定表达且不受实验处理影响。常用GAPDH、β-actin、18S rRNA,但不同组织/处理条件下稳定性不同。建议用GeNorm或NormFinder软件评估多个候选内参稳定性后选择。肿瘤组织GAPDH可能变化,建议用TBP或HPRT1。
Q: Ct值过大或无扩增怎么办
Ct>35可能为低表达或引物问题。检查:1)RNA/cDNA质量(是否降解);2)引物特异性(BLAST比对);3)扩增效率(标准曲线R²>0.99,效率90-110%);4)模板浓度(过低可提高用量)。确认无扩增则为基因不表达或引物失败。
Q: 如何判断扩增效率是否合格
制作5倍或10倍梯度稀释标准曲线,slope应在-3.1~-3.6之间(效率90-110%),R²>0.99。效率<90%可能引物不佳或模板抑制;效率>110%可能非特异性扩增或引物二聚体。SYBR Green需看熔解曲线确认单峰。
Q: 组织样品RNA提取困难怎么办
纤维组织(肌肉/皮肤/心脏)难提取:液氮研磨后立即加TRIzol匀浆;脂肪组织去脂后再提取;骨组织需EDTA脱钙。可用试剂盒配合机械匀浆或蛋白酶K消化。RNA易降解,全程冰上操作,DEPC水浸泡耗材。